Вирусы из прошлого и угрозы завтрашнего дня
В доковидные времена многие мамкины эпидемиологи считали, что чума, оспа или крупные волны гриппа, уже ушли в прошлое, и более не воскреснут. Но на самом деле история человечества с точки зрения болезней не линейный прогресс, а постоянная смена волн. Яркий пример волна возвратной лихорадки, вызванной боррелиями, в 20–30‑е гг. в СССР и Восточной Европе. После Гражданской войны и массовой миграции населения, разрушения системы здравоохранения и роста числа бродячих и военных людей, инфекция, связанная с вшами, вновь вышла на передний план (про это я уже писала). В ряде регионов она была одной из ведущих причин лихорадочных заболеваний, особенно в казармах, поездах и лагерях беженцев. Эпидемии не стали глобальной катастрофой масштаба испанки, но показали, что достаточно ослабить санитарный и противоэпидемический контроль, и давно известные возбудители быстро возвращаются в популяцию.
Ещё один пример — волны возвратной чумы в XX веке. Хотя в Европе крупные эпидемии чумы прекратились к XVIII веку, в природных очагах Азии и Африки возбудитель продолжал циркулировать. В 20–40‑е годы в ряде очагов (в том числе на Кавказе, в Средней Азии и в Забайкалье) фиксировались вспышки природного характера, когда люди заражались при контакте с дикими грызунами или их блохами. В 50‑е и 60‑е годы даже после широкого применения антибиотиков оставались спорадические случаи завозных инфекций из Африки и Азии. Это показывает, что патоген, который казался полностью историческим, фактически оставался в системе: достаточно изменить условия (массовые переселения, колониальные проекты, миграции, войны) — и вирус или бактерия вновь получают канал для распространения. История XX века учит нас: главная опасность не в новых инфекциях, а в том, что старые возбудители регулярно выходят из тени, когда условия жизни меняются.
И сегодня палеогенетика, извлекая геномы патогенов из костей, зубов и даже останков мамонтов, показывает: древние инфекции не просто были когда-то там давно. Они остаются в нашей ДНК, в микробном ландшафте и в возможных будущих сценариях эпидемий. Палеопатогеномика, то есть наука о древних возбудителях болезней, за последние годы стала полноценной дисциплиной. Учёные восстанавливают полные геномы бактерий и вирусов из археологических останков людей и животных, и эти микроорганизмы часто называют молекулярными окаменелостями: они дают не только картину прошлых болезней, но и представление о том, как патогены эволюционируют во времени. Работа ведётся специализированными лабораториями, в том числе в Институте Макса Планка (Германия), в Европейском университете в Санкт‑Петербурге (лаборатория палеогеномики под руководством Артёма Недолужко), а также в ряде российских и казахстанских центров.
Обратите внимание на карту и преобладание среди уязвимых стран почти только сплошь умеренных по климату
Одной из самых ярких историй палеопатогеномики связана с Yersinia pestis – возбудителем чумы. Ещё в 2010‑х годах группа палеогенетиков во главе с Кристофом Бощертом в Институте Макса Планка реконструировала геномы Y. pestis из европейских могильников XIV века, связанных с эпидемией «Чёрной смерти». Позже дополнительные исследования показали, что волны чумы распространялись по Евразии и в ранний железный век, и даже в поздний неолит. В 2023–2025 гог. российские исследователи, в том числе коллектив под руководством Г. А. Ерошенко в Институте проблем особо опасных инфекций, обобщили данные по реконструированным геномам Y. pestis и показали, что в Европе и Азии действовали несколько основных клад патогена, которые уже к X–XVIII вв. сформировали эффективный трансмиссивный путь передачи через блох. Это означает, что чума не была одноразовой катастрофой XIII века, а оставалась циркулирующим возбудителем на протяжении тысячелетий. Сегодняшние природные очаги чумы в Азии и Африке это не курьёз прошлого, а реальный резервуар старого, но хорошо адаптированного патогена (пост про это тут).
Не только чума оставила в древних костях след. Лепра (Mycobacterium leprae) и туберкулёз (Mycobacterium tuberculosis) были обнаружены в материалах от Западной Европы до Восточной Азии. В 2021 г. палеогенетики из Казахстана и Китая опубликовали данные по 27 индивидам из берелских курганов Алтайского региона и обнаружили не только следы проказы, но и других патогенов: Escherichia, Fusobacterium nucleatum, Streptococcus pneumoniae и даже Treponemadenticola – бактерий, вызывающих пародонтит и другие инфекции полости рта. Особенно показательны исследования древних геномов M. tuberculosis: они демонстрируют, что основные линии туберкулёзного комплекса сформировались уже в неолите и ранней бронзе, а волнам их распространения соответствовал рост плотности населения и развитие оседлого сельского хозяйства. Сегодня, несмотря на наличие лекарств, туберкулёз остаётся одной из ведущих инфекционных причин смертности в мире: по оценкам ВОЗ, ежегодно от него умирают около 1,3 млн человек. Это показывает: болезни, которые мы считаем хроническими или контролируемыми, существуют в виде долгоживущих линий патогенов, и их эволюция продолжается в реальном времени.
Сочи - ныне так любый курорт для многих. В конце XIX - начале XX века окрестности были зоной расселения малярийных комаров и почти целиком заняты болотами.
В январе 2026 г. международная группа палеогенетиков заявила о реконструкции древнейшего известного генома Treponema pallidum, бактерии, лежащей в основе сифилиса и других трепонемных заболеваний. Геном был извлечён из кости человека, найденного в Колумбии, возрастом около 5500 лет. Необычно то, что этот древний штамм не соответствует ни одному из современных вариантов трепонем: он отличается от сифилиса, фрамбезии и беджеля. Это означает, что в Америке уже задолго до европейского контакта существовала отдельная, давно потерянная ветвь патогена. Такие находки показывают, что трепонемные заболевания имели гораздо более сложную и древнюю историю, часть линий патогенов могла исчезнуть из‑за смены образа жизни, миграций или вымирания популяций, а также что потенциально спящих вариантов патогенов могло быть больше, чем мы предполагали. Это напоминание, что современная клиническая картина не всегда отражает полную эволюционную историю заболевания.
Палеогенетика патогенов сегодня работает не только с людьми. В 2026 г. международная группа с участием российских учёных, в том числе Алексея Тихонова, опубликовала крупнейшее исследование по ДНК микроорганизмов, связанных с мамонтами. В останках от 1,1 млн до 4 тыс. лет учёные изучили 483 геномных набора и обнаружили 6 основных групп микробов, которые жили в организмах мамонтов при жизни. Особенно примечательно, что в некоторых экземплярах были найдены цисты древнего паразита из рода Eimeria – близкого к видам, которые сегодня паразитируют на современных азиатских слонах и негативно влияют на программы по восстановлению их численности. Это важно в двух отношениях: во‑первых, показывает, что паразитарные и бактериальные инфекции могли играть роль в экологических катастрофах и вымираниях; во‑вторых, демонстрирует, что патогены могут очень долго жить в экосистеме и переходить между видами.
Территории, занятые индейскими племенами в конце XVII века в Америке. Не последнюю роль в их истреблении сыграли те самые оспенные одеяла. Повод задуматься.
Палеогеномика не только реконструирует прошлое. Она даёт несколько тревожных, но важных сигналов для будущего. Во‑первых, старые возбудители никуда не исчезли: чума, туберкулёз, трепонемные инфекции и другие патогены продолжают существовать в природных резервуарах и в человеческом населении. Они не ушли в историю, а просто перешли в более скрытые формы – латентные инфекции, хронические формы, организованные по очагам. Во‑вторых, эволюция этих микробов идёт быстро: сравнение древних и современных геномов Y. pestis и M. tuberculosis показывает, что патогены постоянно адаптируются – меняется их вирулентность, способность к персистенции и устойчивость к факторам окружающей среды. В‑третьих, климатические изменения, вырубка лесов, освоение новых территорий и рост связанности между регионами создают идеальные условия для возврата старых инфекций и переселения патогенов из животных к человеку. Модели, построенные на основе палеопатогеномных данных, показывают, что в прошлом волны чумы часто шли по следам миграций и торговых путей. В‑четвёртых, палеогенетики находят в останках бактерии, которых нет среди современных штаммов, что говорит о том, что часть микробного разнообразия ещё не известна медицине. Теоретически некоторые из таких линий могут заново выйти в человеческую популяцию при изменении экосистемы или поведения людей.
Учитывая современные данные, можно обозначить несколько реалистичных, хотя и не кликбейтных, причин для беспокойства. Одна из них это возвращение забытых форм уже известных инфекций, например, появление более агрессивных или устойчивых вариантов туберкулёза или чумы. Вторая – рост антибиотикорезистентности как продолжение естественной эволюции, которую мы только ускоряем с помощью массового применения антибиотиков. Третья – расширение зон контакта между людьми и дикими животными, включая рынки живности, разрушение экосистем и природные катастрофы, что повышает риск новых зооантропонозов.





































